吃完饭咳嗽的原因，通常是胃食管反流。吃完饭咳嗽是与进食相关的咳嗽，与进食相关的咳嗽中，胃食管反流是主要的病因。
胃食管反流指的是胃的胃酸，或者胃内容物反流到食道，刺激咽部，甚至会刺激气道，从而导致咳嗽，这种咳嗽的出现通常与进食相关。另外，还可能伴有胃食管反流的消化道症状，例如反酸、打嗝、烧心等。
如果有此类伴随症状，就要考虑是否有胃食管反流，可以针对胃食管反流进行治疗。如果经过标准化的胃食管反流治疗，咳嗽有所缓解，也反证咳嗽是胃食管反流引起。
没有胃食管反流的伴随症状，也不一定就不是胃食管反流引起的咳嗽。因为医学上有无症状反流的疾病，也就是虽然有反流，但是没有明显的临床症状，此时需要做24小时pH值监测，确定诊断。
