肠功能紊乱一般是暂时性的状况，如进食不洁食物、过饱、食物冷热交替、消化不良、着急生气等均可引起短暂功能紊乱。上述功能紊乱通过自身调节，饮食注意或药物治疗可缓解。但肠易激综合征病史较长，属于功能性肠病。肠易激综合征的诊断，症状需持续3个月到半年以上，且治疗上除针对肠道药物外，如解痉止疼药物，一般还要加上抗精神焦虑的药物进行综合治疗。

肠易激综合征病史相对较长，与精神情绪相关，肠功能紊乱即短暂性的功能紊乱，经过调节可快速恢复。