间质瘤通常在胃里面，一般发生在胃底，在胃壁的第四层，是固有肌层的病变。因为胃间质瘤是在黏膜下层，所以表层用的普通胃镜，只能看到是隆起病变，但是到底是有多大、有多深，性质怎么样都观察不到。因此需要使用超声内镜。

超声内镜常规分为大探头和小探头，不管是哪一种探头，都可以做相应检查，只不过大探头看得更远、更深，可以看到胃壁腔外病变。因此对于3cm、5cm、6cm的间质瘤，大探头的超声内镜都可以观察清楚病变。同时在超声内镜底下，还可以进行相应的穿刺检测，可以穿刺出来一部分病变组织，进行相应病理学检查。