在植入心脏起搏器时，电极是通过血管放到心脏，而且要经过穿刺部位，血管内皮肯定会受到损伤。通常前期可能会受到损伤，但是内皮修复能力较强，通常均可修复。

起搏器电极还有刺激血管的作用，可能会引起血栓，部分抑酸症的患者可能会引起操作血管闭塞或者疤痕形成，此类情况比较少见，引起的后果问题不大，只是将来可能导致再植入新的起搏器电极有困难。