急性上呼吸道感染最常见的是病毒，包括鼻病毒、冠状病毒、腺病毒以及熟悉的甲型、乙型流感病毒、副流感病毒等以及呼吸道合胞病毒、柯萨奇病毒、艾柯病毒等。细菌方面可以是有细菌溶血性链球菌、嗜血杆菌、肺炎链球菌、葡萄球菌以及革兰氏阴性杆菌，上述都是易引起上呼吸道感染的病毒以及细菌，现在支原体、衣原体非典型致病菌引起的感染也日益多见。