排尿时侧腹部疼原因如下：
1、多数跟前列腺有关，临床上70%左右都是前列腺方面的疾病，前列腺主要有炎症、肥大、增生、囊肿甚至前列腺癌等病症；
2、膀胱问题：膀胱炎、膀胱张力下降，甚至膀胱结石；
3、腹部症状：比如疝气、腹股沟淋巴结肿大或者精索静脉曲张，甚至睾丸、附睾问题，都有可能因为排尿时张力变化、压力变化影响到局部血液循环、神经肌肉牵拉，引起异常感觉。其中也包括胀、痛、麻等情况，所以要进一步检查。