微创手术治疗前列腺增生一般属于中低风险手术，风险主要体现在前列腺术后出血。前列腺术后出血发生率大约是2%-5%，轻度出血即尿中带血或尿呈洗肉水样，一般可以自愈。随伤口恢复大约需3-5天，若恢复较为缓慢，一周左右血尿基本可以停止；但是对于出血严重的患者需要应用止血药物，部分可能需要重新通过手术止血，因此出血是前列腺手术后最大的风险之一。
其它风险则包括尿道狭窄、尿失禁、逆行射精等，发生几率在5%以下。总体而言，微创手术风险较小，但术中风险需要加以重视。术中风险主要是手术时间过长引起稀释性低钠血症，称为电切综合征。但医生会进行密切关注，所以患者无需担心。
