脑脓肿晚期，即脓肿壁形成期，此时脓肿壁已经较完全、较厚，会引发患者急躁性神经症状、癫痫等。需进行手术切除，包括完整切除脓肿壁、脓腔，手术时一定要注意避免脓肿发生破裂，因为一旦出现破裂，有可能引发新的脓肿。

患者再次出现脑脓肿，属于非常严重的情况，而且也不利于尽快恢复，所以手术时一定要加强保护，谨慎操作。脓肿需按照脓壁的边缘进行完整切除和剥离，只要手术时未出现脑脓液渗漏，结合术后应用抗生素4周左右，多数脑囊肿预后较好。