儿童急性肾炎最常见的病因是感染，儿童急性肾炎主要是由于溶血性链球菌感染所引起。所以往往可以找到有前驱的感染病史，如起病前10天左右有过咽炎，或前20天左右有过皮肤感染的病史。还有其它的细菌，包括肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌等也可以引起急性肾炎。

常见的EB病毒、柯萨奇病毒、麻疹病毒、水痘-带状疱疹病毒等病毒感染，也可以出现急性肾炎或肾病综合征的表现。还有一些非特异性的病原如支原体的感染，一小部分的儿童也可出现肾炎的临床表现。