手足口病由很多不同病毒引起，主要由肠道病毒EV71、柯萨奇病毒等引起，各型间没有交叉。另外，手足口病的免疫能力也不是很持久，如果得过手足口病还可能会再得，得过某种类型病毒引起的手足口病，还能得其它病毒引起的手足口病。
手足口病主要在6个月到5岁小孩中发病率比较高，特别是1-2岁的儿童。6个月以下的小孩，主要有母亲免疫存在，所以得手足口病的机会并不太高，到6个月时母亲给的免疫能力减少或者消失，所以容易生病。再大一点的孩子又可能建立自己的免疫，所以得病的机会也会少一些，而且小婴儿得了手足口病还容易加重，出现脑炎等很严重的病情，所以预防很重要。手足口病现在已经有疫苗，也可以注射疫苗预防手足口病的发生。
