在进行前列腺囊肿手术前，可以对患者采用椎管内麻醉、全身麻醉。对于椎管内麻醉，可以采用硬膜外麻醉、腰麻，经过棘突之间的椎间隙将麻药打入椎管内，不管是蛛网膜下腔或硬膜外腔，都可使下半身产生麻醉作用，从而完成手术。椎管内麻醉应注意局麻药使用的并发症，比如扩张动脉、静脉，患者可能出现低血压、呼吸抑制，术后出现恶心、呕吐，腰麻后可出现头疼等。
全麻涉及到镇静、镇痛、肌松，还有进行气管插管、应用喉罩，可出现血压下降、呼吸抑制、恶心、呕吐、尿潴留等。通常对于上述并发症，有经验的麻醉医生均可妥善处理，对患者较为安全。部分患者可能不愿意进行半身麻醉或椎管内麻醉，此时可以进行全身麻醉，在麻醉医生的掌控之下均较为安全有效。
