腰椎核磁共振和CT是两种不同检查方法。CT是通过X线断层扫描，人体组织吸收X线所成像的一种方法，是一种有电离辐射的检查方法。腰椎核磁共振是通过电磁波和强磁场使氢质子发生共振的原理来产生的一种图像，没有电离辐射，所以核磁共振是无电离辐射的检查方法，对于患者检查的影响比较小。

但在有些特定环境下需要做腰椎核磁共振，比如患者压缩骨折，到底是急性期压缩骨折还是慢性压缩骨折，需要核磁共振进行鉴别。而如果患者发生横突骨折、附件骨折，核磁共振往往会漏诊，腰椎CT会显示出优势，根据患者的不同病情来决定。如果要观察椎间盘、椎体、椎管内情况，首选腰椎核磁共振。因为核磁共振的软组织力分辨率非常高，对于椎间盘膨出、突出、脱出、椎管狭窄以及神经病变的准确率非常高。但如果这些病变来源于骨质，比如来源于骨肿瘤、附件骨折、横突骨折时就需要进行腰椎CT检查。

所以关键是患者疾病类型，需要进行哪种检查，医生会开相应检查申请单，建议患者听从临床医生的医嘱进行检查。