临床上若囊肿持续存在或越来越大，逐渐影响患者健康，可通过卵巢囊肿穿刺解决。穿刺一般在超声引导下进行，患者可出现疼痛，必要时可注射镇痛药，如安定、杜冷丁等，缓解疼痛。术后主要预防感染及出血，因此患者在穿刺后需注意休息，避免剧烈活动，两周内禁止性生活，保证正常作息。此外，患者需放松心态、保持良好作息规律，预防并发症的发生。
临床上患者由于卵巢功能下降或内分泌失调，不能正常排卵，可采用促排卵药物促进排卵，但卵泡成熟后不能自然破裂，便不能受孕。临床上为使卵泡破裂、受孕，可应用破卵针促进排卵。若卵泡仍不能破裂，可形成生理性囊肿，即卵巢囊肿，一般对患者健康无影响，无需特殊处理，3个月可自然消失。
