胃间质瘤术后复发大多位于胃部或胃和食管接头，或胃和十二指肠接头部位。患者可出现不适症状，如术后腹胀、腹痛，或远处转移症状，如转移到肺部，表现为肺部症状，转移到肠管，表现为腹胀或便秘、腹泻。胃间质瘤复发有时需做CT或胃镜等检查，影像能够明显看到肿瘤或转移病灶。有些病人术后也可因肿瘤生长破溃表现便血、消瘦等症状。