甲沟炎手术需要行局麻或神经阻滞麻醉，因此手术过程中只有轻微疼痛或者没有疼痛。如果甲沟炎患者有明显的甲沟旁脓肿，脓肿产生明显的红肿、疼痛以及发热症状，有发生化脓性骨髓炎的风险，需要在局麻或神经阻滞麻醉下行拔甲术、脓肿切开排脓术、引流术。
甲沟炎手术后需定期换药，使用双氧水、碘伏、生理盐水反复冲洗和浸泡伤口，使坏死物质排出，杀灭细菌。换药后可外敷百多邦软膏或盐酸金霉素眼膏，进一步起到保护创面以及消炎杀菌作用，术后患者需用敷料包扎伤口，避免伤口受灰尘或污水的二次污染。如果有需要，患者需在术后口服消炎药物，常用的是头孢类抗生素和阿莫西林等。
