脸上长的扁平疣部分可以通过超脉冲二氧化碳激光和液氮冷冻彻底去除，激光术后3天局部不可沾水，10-14天结痂脱落。在结痂期间尽量不要用手抠掉，让其自然脱落，伤口愈合比较好，也不容易留色素沉着和疤痕。

冷冻后一般可以沾水，但结痂不能自行去除。对于反复发作数量较多的扁平疣，也可以口服和外擦抗病毒的汤药，比如薏仁合剂。扁平疣有一定传染性，疾病活动期切忌用手搔抓，一般会有同形反应。扁平疣患者还需要增强体质、保证睡眠充足、避免紧张劳累，通过提高机体免疫力也可以防止扁平疣的复发。