小儿动眼神经损伤的预后，和损伤原因以及损伤程度都有关系。

发生小儿动眼神经损伤，早期可以用药物保守治疗，包括营养神经药物、减轻水肿药物等。通过药物治疗，多数儿童动眼神经损伤能慢慢恢复。儿童或者青少年因为生命力相对较旺盛，所以恢复的可能性较大，治愈的可能性较大。

如果通过药物治疗，超过六个月患儿的动眼神经损伤之后引起的症状还不能有效改善，可以进行手术干预，一定要经过药物治疗超过六个月之后无效再进行手术干预。