腹部超声诊断早孕需要适度充盈膀胱，但是经阴道超声诊断早孕，不需要充盈膀胱，相对而言，更方便、快捷，尤其适用早孕期妊娠反应严重、憋尿困难女性。阴超观察子宫内膜细微结构变化比腹部超声更有优势，比如异位妊娠时候，子宫内膜受到雌激素影响，会有蜕膜改变，伴少量宫腔积血，和宫内孕特别相似，通过阴超可以鉴别是双环征妊娠囊，还是单环征假孕囊。而且阴道超声观察妊囊大小、位置、发育情况，包括胚芽、有无心管波动等，都比腹部超声更准确、更直观，准确性和敏感性更优于腹部超声。
经阴道超声诊断早孕比经腹部超声诊断提前5天左右，经腹部超声不容易显示5mm以内疑似妊囊小暗区，但经阴道超声可以尽早发现。此外，阴道超声对于异位妊娠诊断也具有意义和优势。
