先天性心脏病是先天性的因素引起，先天性因素与孩子基因有关系。其实先天性心脏病有很多种，10%是有明确的基因突变，也称为基因病，但先天性心脏病成因非常复杂，除了自身基因以外，还与环境因素有非常大的关系。是否受到射线的影响，还有与孩子妈妈在怀孕期间是否服用产生畸形的药物有关系。
目前科学技术验证发现，只有10%的先天性心脏病能够明确找到相对应的基因突变，而其它先天性心脏病目前还没有确定的病因。另外90%的天性心脏病，更多的是环境因素和基因突变联合造成的结果。很多家长如果想明确知道先天性心脏病是如何引起，建议孩子父母、孩子先做基因筛查，把明确基因病变筛查出来。如果筛查结果没有明确基因突变，可能是环境因素，再加上基因因素共同作用的结果。