膀胱镜检查的害处与患者适应症不规范，临床医生操作手法不熟练、临床经验不足有关。适应症不规范指患者适应症不强烈或者不适合进行膀胱镜，但仍然进行膀胱镜检查，将会出现以下情况：

1、膀胱镜检查前需排除急性炎症、高烧等，以防对黏膜造成磨擦损伤，导致细菌入血、感染，加重炎症；

2、对于尿道狭窄的患者膀胱镜不能通过正常渠道进入，强行操作会导致黏膜擦伤、炎症、出血、出现尿道穿孔。如果使用暴力、操作不当，则会出现直肠穿孔等，导致相应的并发症。

膀胱镜针对适应症检查治疗十分重要，患者感觉到的痛苦比较少，检查结果也较为满意，应规范检查，将膀胱镜检查的危害降到最低。