婴儿的毛囊炎是否会自愈，是否需要干预取决于轻重程度。如果炎症很轻，只是很小的红色丘疹，并且数量很少，不干预完全有可能自愈。如果炎症比较重、数量很多，甚至引起淋巴结炎、全身的反应、发热等，应该尽早干预，避免出现不良反应或者严重的并发症。毛囊炎的发生和个人体质、外界环境有关，它是细菌感染，细菌适合在温暖、潮湿的环境生长，所以如果保持局部或者全身清洁、干燥，可以减少发生。
如果毛囊炎总是反复的发生，并且比较严重，一定要明确是否有先天免疫缺陷的问题，是否为皮肤或者全身的免疫功能不好导致感染性疾病的反复发生。如果炎症比较重或者数量非常多，可以外用夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏等，甚至可以口服抗生素药物，比如头孢类抗生素，或者其它抗生素。
