不明原因的消化道出血，一般常见于小肠疾病，如小肠肿瘤、血管病变、炎症性肠病、小肠憩室等。

如果做胃肠镜检查多是查不到原因，考虑是小肠病变引起的出血，可以做小肠CT或者核磁共振，还可以进一步查胶囊胃镜。胶囊胃镜是一颗胶囊，里面都是摄像头，吞服以后可以通过食道、胃进入小肠，胶囊胃镜一边往小肠走，一边拍照片，后期可以通过肛门排出。拍摄的照片传输到电脑，通过电脑观察照片，发现病变。进一步可以做小肠镜检查，如果出血量较大，还可以做血管造影检查。

消化道出血患者常规会做血常规、大便隐血试验、腹部增强CT、胃肠镜检查。如果是胃肠镜检查都查不出原因，而患者又有黑便、便血、缺铁性贫血，或者大便反复隐血试验阳性等明确有消化道出血的证据，称之为不明原因的消化道出血，一般占全部消化道出血的3%-5%。