左侧附件囊肿是否会癌变，需根据囊肿性质判断：

1、生理性囊肿：B超提示囊肿壁薄、透亮，直径不超过5cm，随着月经周期的变化，尤其是在月经干净2-3天以后，复查B超囊肿自然消失；

2、病理性囊肿：无法明确良恶性，或者持续观察3个月以上，囊肿持续存在，甚至出现了下腹坠痛、月经改变，这样的囊肿不建议观察，一定要到正规的医院来做B超，必要时做CT、核磁检查，还要加肿瘤标志物检查，让妇产科大夫帮助你来判断囊肿是不是有癌变。如果考虑良性的囊肿，如肿瘤标志物检查正常，CT、B超提示囊肿的囊壁薄、光滑，癌变几率相对较小；如果B超提示近期内有增大，甚至是囊实性改变，肿瘤标志物CA12-5、CA19-9，甚至HE4这些特异性的肿瘤标志物升高，考虑有恶变，需要手术治疗。