发生鼻窦炎，尤其是慢性鼻窦炎，通常优先进行药物治疗，如果药物治疗效果不好，才需要手术治疗。另外如果急性鼻窦炎，病人症状较为明显，如高烧引起明显的头疼症状，伴有鼻塞、脓涕。并且影像学检查，发现一侧或者全组鼻窦炎症较重时，也可以急诊进行鼻窦的窦口开放，能够使脓性分泌物尽快引流，避免并发症。
目前进行鼻窦炎的手术，通常在全麻下，通过鼻窦内窥镜进行，所以为微创手术。鼻窦炎手术，主要是将鼻窦口进行开放，使鼻窦引流通畅。同时也需要应用药物，进行配合治疗。如术后应用鼻用的生理盐水或海水，继续进行鼻腔喷雾以及冲洗。同时持续应用激素类的喷鼻药，进行喷鼻治疗，如糠酸莫米松、雷诺考特，才能使鼻窦炎得到彻底治愈。
