儿童类风湿病主要并发症是脏器的损伤，如心肺损伤时可能会出现心肌炎或者胸膜炎疾病，也可能会引起肾脏损伤。

当患者心肺损伤时，可能会出现心功能下降，比如心衰。肺脏方面损伤主要表现为间质性肺炎，严重者可以出现呼吸衰竭症状。肾脏出现损伤可能表现为蛋白尿或者水肿症状。脏器出现损伤时，严重者可能会危及生命，所以此病要引起患者的重视。