全身神经痛的原因，可能是神经肌肉疾病引起，如多发性肌炎会出现全身神经痛的症状。还有周围神经病变，包括电解质紊乱引起的周围神经病变，或者是电解质紊乱本身也会出现全身神经痛的症状。

糖尿病引起的周围神经病变，以及长期喝酒慢性酒精中毒，也会引起全身神经痛的症状。维生素B1缺乏，维生素B12缺乏，都会引起周围神经炎症，全身神经痛的症状。自身免疫性的周围神经炎症，也会导致全身神经痛的症状。

神经压迫也会引起此类情况，还有全身性疾病，包括骨质疏松、血钙降低，会引起全身神经痛的症状，可以通过补充降钙素改善血钙，进而改善症状。还有低血糖、贫血、电解质紊乱，会出现全身神经痛的症状。

大脑的缺血、缺氧，导致全身神经痛，神经功能下降引起的症状。还有心理精神疾病也会表现出全身神经痛。通过检查不存在神经的问题，焦虑症、抑郁症、精神分裂症，都可以表现出全身神经痛的症状。