激光作用到皮内组织以后由于色素细胞对激光剂量超乎正常的吸收，造成色素细胞在短时间内得到高能量，从而迅速崩解，使残存的色素颗粒最后被皮肤组织内的细胞吸收以后达到祛除目的。

皮肤出现色斑是因为局部色素发生改变，不同颜色对不同的光吸收不一样，如果是偏白的皮肤，对光反射的多、吸收的少。皮肤如果颜色偏深，如皮肤局部色素改变，发红或发黑会选择性吸收光，这是物理现象。激光利用该原理选择祛红或祛黑激光，利用含有色素的斑块与正常皮肤对不同波长的激光吸收不同来达到治疗目的。