肛周脓肿是在肛门周围，也可能在肛缘，离肛门有一定距离的位置，距离肛门2cm、3cm、5cm都有可能。总而言之，肛周脓肿是在肛门周围，最常见于直肠后深间隙、直肠后浅间隙、坐骨直肠间隙、骨盆直肠间隙，但是，这些间隙都是包围着直肠和肛管，因此称为肛周脓肿。

如果是与肛门不通的脓肿，不能称为肛周脓肿，只能称为疖子。肛周脓肿最重要的特点是与肛门相通，在肛门周围有肛门后深间隙，也有浅间隙，两侧可能是坐骨直肠窝脓肿和骨盆直肠窝脓肿，也有皮下脓肿，即特别表浅，只有一层皮。