精神分裂症目前有一种神经发育异常假说认为，由于遗传易感性和某些神经发育危险因素，如妊娠期与出生时并发症、怀孕期间暴露于流感病毒或者母爱剥夺等相互作用，在胚胎期大脑发育过程中出现某种神经病理的改变。

主要是新皮质形成期的神经细胞，从大脑深部向皮质迁移的过程中出现紊乱，从而导致心理整合功能异常，即刻效应并不显著，但随着进入青春期或成年早期，在外界环境因素的不良刺激下，会导致患者出现精神分裂症。