肺结核晚期时，患者的肺组织损伤较严重，肺功能损伤也较严重，甚至影响到其它器官的功能。对于治疗效果不理想的患者，肺内反复出现坏死灶和增加纤维灶，同样也会造成肺组织大量损伤，导致肺功能受损。

肺损伤还可以引起肺源性心脏病，晚期除出现结核病的一般症状以外，还可出现呼吸困难。而肺功能损伤严重的患者，则可出现稍微活动就出现喘息，甚至无法活动。如果是患者肺功能损害较重，同时存在肺源性心脏病，还会出现下肢水肿，无法平卧。