低分子量肝素是和普通肝素相比，或者在普通肝素的基础上，经过化学生物方法使普通肝素糖链减低、分子量减低，只取得低分子量肝素。

和普通肝素相比，低分子量肝素主要是抑制活化的X因子，对凝血酶的抑制作用减低。使用低分子量肝素可以更好的抗凝，而减少出血可能，但是低分子量肝素仍然有引起临床出血的可能。一般临床使用低分子量肝素，小剂量可以不做监测。如果持续静脉滴注或者大剂量应用低分子量肝素，仍然要做实验室监测。现在推荐的方法是监测活化X因子，该方法快速、敏感，而且重复性好。