怀疑胆总管囊肿时，需要一系列检查明确诊断，最简单的检查是B超，基本可以明确囊肿大小、位置、胆道扩张程度。如果是仔细检查，可以通过CT或者核磁共振，最形象直观的检查是核磁共振，可以看到胆道、胰管、胆管的细节。

其他检查，如血液检查，出现胆道梗阻的胆总管囊肿患者，可出现胆红素指标升高或者肝功能异常，辅助检查都可以帮助诊断明确。另外，还可以做ERCP有创检查或者胆道造影。通常采用普通B超、血检、CT、磁共振等明确诊断。