衣原体、支原体都是病原体，这种病原体还能分出不同类型，病原体感染的部位不同可引起不同部位的疾病，而决定了临床症状：
1、呼吸道感染，可能引起支原体肺炎，会出现咳嗽、咳痰。支原体肺炎可能年轻人更多见，咳嗽、干咳多一些，咳嗽症状比较突出，痰不是很多，可能会出现肺部间质性肺炎的改变。另外，它有一定的传染性，比如通过呼吸道，通过咳嗽、喷嚏可以传染给其他人；
2、衣原体感染泌尿生殖系统，可以引起泌尿生殖系统感染的症状，比如可以引起尿路感染症状。生殖系统感染衣原体以后有些人可以出现发烧、局部不适，可以尿里出现白细胞，也可以出现尿路刺激表现。
所以，支原体和衣原体的感染是根据感染部位而引起的症状有所不同。