缺乏碘会导致一系列与甲状腺相关的疾病。严重缺碘时整个机体的生长发育和智力水平都会受到严重影响，以往的研究也发现，碘缺乏可能导致甲状腺激素合成不足。
在某些地方，由于碘的不足，可能会出现地方性甲状腺肿，以前被称为大脖病，当地碘缺乏特别严重时由于甲状腺激素严重不足，可能会出现克汀病，也称为呆小病。在这些地方，孩子出生后由于甲状腺激素合成不足，会影响智力发育，导致严重的智力障碍，同时影响肢体发育，面容也较为丑陋，肢体的行走也不正常。
另外，在妊娠期，妇女碘缺乏会影响胎儿的甲状腺激素水平，进而对胎儿的神经系统和智力发育产生影响。而且，孕妇本身在整个妊娠过程中容易出现胚胎发育异常，可能导致流产或早产等情况。因此，碘缺乏仍然会引起一系列甲状腺相关疾病或对机体状况产生影响。
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