地塞米松磷酸钠与地塞米松一样，主要用于过敏性与自身免疫性炎性疾病。地塞米松磷酸钠主要有两种剂型，注射剂以及滴眼剂，滴眼剂主要用于虹膜睫状体炎以及虹膜炎、角膜炎、过敏性结膜炎、眼睑炎以及泪囊炎等。长期频繁使用地塞米松磷酸钠可以引起青光眼、白内障，诱发真菌性眼睑炎。地塞米松磷酸钠的注射剂长期使用，可以引起向心性肥胖、满月脸、体重增加、下肢浮肿，还可以引起出血倾向，使创口不容易愈合，有些会出现痤疮、月经紊乱或股骨头缺血性坏死，由于骨质疏松还可能引起压缩性骨折或长骨病理性骨折。

地塞米松磷酸钠还可以引起肌无力、肌萎缩、低血钾综合征以及胃肠道刺激，如引起恶心、呕吐，严重的还会引起胰腺炎、消化性溃疡甚至穿孔。如果是儿童使用，还会使儿童生长受到抑制。有些糖耐量减低或本身有问题的病人，用了地塞米松后会出现糖耐量减低，以及本身有糖尿病的病人会加重糖尿病。因为这是注射剂，所以很多病人容易出现精神症状，出现类似于激动、谵妄、不安、定向力障碍，甚至表现为抑郁、欣快这两种不一样的反向精神表现，患有慢性消耗性疾病或以往有过精神不正常的病人会出现精神症状。