左肝萎缩是左肝的胆管或血运受到阻碍，导致左肝反复出现炎症与营养不良，进而发生萎缩。左肝是结石好发的部位，因为左肝管以近乎直角的方式进入肝总管，而上述解剖学形态不利于胆汁的排放，会导致结石易滞留在肝总管。

大量结石阻塞在左肝管后，会导致左肝的胆汁排放不畅，反复诱发炎症，从而促使胆管与肝脏的萎缩，同时可以导致左肝出现血运障碍而造成萎缩，使肝脏呈现病理性状态。在进行胆石症切除手术时，医生需保证患者胆管通畅引流的前提下，将萎缩的病肝切除，否则会导致炎症持续存在且反复发作，容易转变为胆管细胞癌，而胆管细胞癌的预后并不乐观。