全身各部位病灶均可以进行超声介入穿刺，不同脏器、不同病灶性质、不同穿刺方式产生效果以及不良反应或后遗症不同。随超声介入穿刺技术不断改进，尽管穿刺后出现后遗症发生率较低，但仍然不可能完全避免。后遗症主要有以下几种：

1、穿刺后血肿形成，如果发生在肾穿后血肿较大，可能压迫肾动脉或肾盂，引起继发性高血压或肾积水，甚至诱发尿毒症；发生在肝穿后，血肿较大可以压迫胆管引起胆管扩张，继发黄疸；

2、肾穿损伤血管可以形成动静脉瘘，导致长期肉眼血尿；

3、肝穿损伤胆管可以引起胆管狭窄或胆汁性腹膜炎；

4、恶性肿瘤针道种植，尽管多中心研究表明发生率极低，但仍然会发生小概率事件。