男性也可感染高危型HPV病毒，但概率较小，相对女性更易清除。目前已知HPV病毒总共200多种，根据致癌风险，分为高危型与低危型，高危型主要引起生殖器癌变，低危型通常不会导致癌，只会引起生殖器疣与良性病变，HPV病毒喜欢在黏膜生长，男性主要生长在阴茎、肛门、口咽。宫颈癌与高危型HPV感染的关系已明确，高危型HPV持续感染可导致宫颈癌。

男性部分恶性肿瘤也与高危型HPV感染相关，80%阴茎癌、50%口咽癌、30%肛门癌均与HPV感染，尤其高危型HPV持续感染有关，因此对男性也需注意HPV筛查，如果有条件建议男性青少年注射HPV疫苗。