相对于肝外胆管结石或胆囊结石，肝内胆管结石的治疗较为复杂。肝内胆管结石称为肝胆管结石，我国较多见，属于较难治的胆道疾病。无症状胆管结石无需治疗，定期观察随访。若患者的临床症状反复出现，应进行手术治疗，手术原则为尽可能取净结石，解除胆道狭窄或胆囊梗阻。此外还需去除结石部位和肝脏病灶，恢复并建立胆汁引流通道，防止结石复发。手术治疗措施包括经胆道镜下进行肝内胆道取石，激光和超声碎石等。大多数肝内胆管结石患者，经过积极治疗后可治愈。

肝内胆管结石的发病原因较为复杂，主要与胆道感染、胆道引流不畅、营养不良等因素有关。多数患者可出现上腹部和胸腹部胀痛不适，随着病情发展可引起急性胆管炎，导致患者出现寒战、高热或腹痛，反复发作的胆管炎可以导致肝脓肿。若患者反复出现寒战、高热或腹痛等症状，应进行超声检查或MRCP检查明确诊断。