若智齿长得比较正，没有长歪，并且完全长出，则通常没有什么危害，与其它牙一样。但智齿长歪了，如往前长，有可能将前面的牙顶坏，甚至造成前面的牙出现牙根吸收，可能需要根管治疗或拔牙。继续往前长，还可能引起牙列不齐，尤其会导致矫正完成的牙齿出现牙列不齐的复发。智齿未完全长出，远中有牙龈覆盖，牙龈可能会反复发炎，称为智齿冠周炎。
严重的感染可能会扩散，引起脸的肿胀，甚至张口受限。若往口底间隙、咽旁间隙扩散，甚至会影响气道、威胁生命。若牙未完全长出，智齿周围可能会出现囊肿，如角化囊肿、含牙囊肿等，严重的甚至会引起截骨。若智齿往颊侧或舌侧长，可能会咬到腮帮。总之智齿若长歪或未长出等情况，会引起许多不利于身体健康的问题，经过拍片和临床检查，明确诊断，尽早将智齿拔掉。
