垂体柄阻断综合征治疗主要是激素的替代治疗，具体如下：

1、如果出现促肾上腺皮质激素减少，通常用肾上腺皮质激素进行替代治疗，临床上常见的有糖皮质激素，如强的松等；

2、如果发现促甲状腺激素分泌减少，可直接使用甲状腺激素，最常见的左旋甲状腺素片，即优甲乐，可补充甲状腺激素；

3、促性腺激素减少，可以补充性腺激素，如女性的雌激素、孕激素，男性可补充睾酮类的激素。    

另外，要注意在进行激素替代治疗时，注意控制补充的量，不能补过量，过量可出现副作用，而不利于人的身体健康。