甲状舌骨囊肿需要进行手术治疗。如发现颈部囊肿应鉴别囊肿为单纯囊肿或甲状舌骨囊肿。通过检查后高度怀疑为甲状舌骨囊肿，需行进一步鉴别，因部分颈部肿块或甲状腺组织可能为异位甲状腺。

甲状舌骨囊肿患者，需行ECT甲状腺扫描，通过放射性元素判断甲状腺功能。排除异位甲状腺，必须进行手术切除。因甲状舌骨远端开口于舌盲孔位置。如患者未行手术治疗，可导致感染反复出现。感染后需对囊肿进行切排、反复换药、填塞纱布，且伤口较难愈合。因此对于诊断明确患儿，建议未出现感染时行手术治疗，以减患儿心理及身体创伤。