阴茎短小分正常情况、异常情况，正常情况如寒冷、紧张，均可引起阴茎外观短小。通常阴茎短小指小儿正常勃起情况下，较正常小儿明显短小，建议家长携儿童到医院进行阴茎长度测量，包括B超检查与阴茎拉伸长度测量。

阴茎不同年龄段均有相应长度，如果长度比正常平均值明显低，即阴茎短小，严重的情况称为隐匿性阴茎。低于2.5个标准差即小阴茎，疾病更加严重。