复方消化酶胶囊空腹服用会伤胃，复方消化酶胶囊里有胃蛋白酶原，胃蛋白酶原增多本身就可以导致胃黏膜的急性损伤，含有消化酶类的药物需要在餐中或者餐后服用，避免胃蛋白酶原对胃黏膜造成直接损害。现在有很多酶系，比如复方消化酶、米曲菌胰酶片等，各种类型消化酶的量和酶的含量不一样，需要根据不同情况选择不同的酶系。
对于消化酶的服用量，需要分清楚是绝对的消化酶分泌不足，还是相对的消化酶分泌不足，需要去医院消化内科让医生进行评估。对于绝对消化酶分泌不足的人群，消化酶的使用量较大，消化酶需要注意在餐中或餐后服用。相对消化酶分泌不足的人群，消化酶的使用量可能较小。
