如果巨结肠一旦诊断，治疗方法是手术切除病变肠管，还要切除因为近段肠管，因为肠段被动扩张，造成局部的内环境紊乱，肠管功能不良，需要切掉一部分病变肠管，还有过渡段的肠管都要切掉。巨结肠的治疗方法根据不同类型，有不同的治疗方法。具体如下：

1、常见型巨结肠：类型最常见的是常见型，称为常见型巨结肠，累及病变的肠管不太长，可以保留大部分结肠；

2、长段型巨结肠：累及＞1/2的结肠，只能保留1/4的结肠；

3、全结肠型巨结肠：是把所有结肠切掉，处理方法也是不一样的；

4、全长型巨结肠：整个肠管都有问题，最终的治疗方法就是肠移植。