长期戴美瞳对视网膜没有影响，因为视网膜位于眼底。但如果长期戴美瞳，可能会对角膜造成伤害。因为美瞳长时间压迫在角膜上，会导致角膜变薄，同时也可能造成角膜的划伤，存在继发感染的风险。如果美瞳透氧率较低，也会导致角膜缺氧，引起角膜的一系列问题。
此外，长期戴美瞳还会加重干眼症，干眼症不单纯表现为眼睛干涩，并且也会导致角膜上皮剥脱，继而引起角膜的糜烂，甚至角膜透明性也会发生改变。因此，并不建议求美者为美容而戴美瞳。即使戴近视接触镜也应尽量短期配戴，使角膜正常呼吸，也可以减少或避免角膜炎及眼内炎症的发生。
