肾穿刺活检前通常会注射麻药，常用为利多卡因，所以通常患者不会疼痛。即使出现疼痛也是在可接受范围之内。肾穿刺活检为肾内科最基本的检查手段，因其不只关系到疾病诊断，也关系到疾病治疗方案及患者预后判断，所以为最基本、最重要的检查。

肾穿刺活检其实非常简单，患者如果能够积极配合，只需数分钟即可完成。通常患者需趴在床上，腹部下面垫上枕头，且操作过程中会让患者呼气，因肾脏是随着呼吸运动上下移动。针刺入后，如果患者还在呼吸，可能会将肾脏包膜划破，易引起出血。故操作时会嘱咐患者深吸气，而后憋住气数秒钟不要呼吸，针刺入很快就会取出组织。