腺样囊性癌属于恶性肿瘤，恶性度较高，晚期反应主要取决于侵及周围组织的程度。如腺样囊性癌可以局部形成较坚韧浸润块，当侵及面神经时患者会出现面瘫；侵及舌神经和舌下神经会导致舌麻木和舌运动障碍。有时腺样囊性癌发生在腭部即上牙膛，肿瘤常可沿腭大神经扩散到颅底，甚至长到颅内，其预后与转移部位相关。

腺样囊性癌特点是易发生远处转移，最常见转移部位是肺，其次也可能会转移到肝、骨和脑等。不同部位症状不同，如转移到肺可出现咳嗽、咳血；转移到肝出现肝部包块；转移到骨会出现明显疼痛等。