呼气试验是根据生物体尿素酶活性来鉴别是否有活性的幽门螺杆菌感染。当呼出气体样本中存在有幽门螺杆菌时，吸入用非放射性同位素碳13或碳14同位素标记的尿素，随之产生同位素标记的二氧化碳，之后对呼出的二氧化碳进行定量检测。该检测方法是目前在临床上应用最广泛的检查，碳13试剂没有放射性，而碳14有放射性。
该检查要求患者在检查前1个月必须没有使用抗生素、铋剂、质子泵抑制剂，质子泵抑制剂包括奥美拉唑、埃索美拉唑、兰索拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑这类药物。有一部分中草药对幽门螺杆菌有抑制作用如丁香花、蒲公英。