抠鼻较为直接的危害，是所抠部位的皮肤和黏膜受到损害。抠鼻子的部位一般在前鼻孔，前鼻孔向内是鼻前庭、鼻内孔，鼻内孔进去后是鼻腔黏膜。鼻涕一般在鼻内孔附近产生，而鼻内孔是鼻腔中最狭窄的部分，因此鼻涕形成的鼻痂常卡在鼻内孔。

抠鼻时可能损伤到鼻前庭皮肤，如果指甲进入鼻内孔，可能损伤到鼻腔内部黏膜。与皮肤抵抗力相比，鼻黏膜较娇嫩更易受损，因此抠鼻会造成局部皮肤和黏膜损害。另外，指甲藏有污垢，包括细菌、病毒或其他有害病菌，可以造成局部感染。因此，抠鼻是不健康的行为，应尽量避免。